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本产品是NTRK1/NTRK2/NTRK3基因融合检测试剂盒(可逆末端终止测序法),属于第三类体外诊断试剂,由南京世和医疗器械有限公司申请注册。该试剂盒用于定性检测实体瘤患者福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本中的NTRK1、NTRK2和NTRK3基因融合变异,作为NTRK抑制剂恩曲替尼的伴随诊断工具。检测结果需结合临床其他信息综合判定,不应作为唯一决策依据。

产品概述
产品主要组成成分如下:
|
组分编号 |
组分名称 |
主要组成成分 |
|---|---|---|
|
B1 |
PCA修复缓冲液 |
Mg²⁺、Tris、dNTP |
|
E1 |
PCA修复反应液 |
DNA聚合酶、多核苷酸激酶 |
|
E2 |
PCA连接酶 |
DNA连接酶 |
|
B2 |
PCA连接缓冲液 |
PEG6000、Mg²⁺、Tris |
|
A1 |
PCA通用接头 |
寡核苷酸 |
|
IP01-IP12 |
PCA文库扩增引物1-12 |
寡核苷酸 |
|
IP01-IP24 |
PCA文库扩增引物1-24 |
寡核苷酸 |
|
IP01-IP36 |
PCA文库扩增引物1-36 |
寡核苷酸 |
|
E3 |
PCA PCR扩增反应液 |
DNA聚合酶 |
|
P1 |
PCA富集扩增引物 |
寡核苷酸 |
|
P2 |
PCA富集探针 |
寡核苷酸 |
|
B3 |
PCA DNA封闭液 |
寡核苷酸 |
|
S1 |
PCA封闭序列 |
寡核苷酸 |
|
B4 |
PCA杂交缓冲液1 |
四甲基氯化铵 |
|
B5 |
PCA杂交缓冲液2 |
甲酰胺 |
|
W1 |
PCA清洗缓冲液1 |
十二烷基硫酸钠 |
|
W2 |
PCA清洗缓冲液2 |
柠檬酸钠 |
|
W3 |
PCA清洗缓冲液3 |
柠檬酸钠 |
|
W4 |
PCA清洗缓冲液4 |
乙二胺四乙酸 |
|
BW |
PCA磁珠清洗液 |
柠檬酸钠 |
|
MB |
PCA磁珠 |
M270链霉亲和素磁珠 |
|
NC |
PCA阴性对照品 |
健康人细胞系DNA |
|
PC |
PCA阳性对照品 |
健康人细胞系DNA、TPM3-NTRK1融合细胞系DNA和NTRK2野生型质粒、QKI-NTRK2融合质粒、NTRK3野生型质粒、ETV6-NTRK3融合质粒 |
注:同一组分不同批号不能混用;PCA为Pan-Cancer缩写。
产品包装规格包括12人份/盒、24人份/盒和36人份/盒。
产品检验原理基于DNA探针捕获技术:从FFPE样本提取核酸DNA后,通过片段化、加接头和PCR扩增制备文库,再使用特异性DNA探针杂交捕获目标区域(包括外显子和内含子区域),经磁珠富集后,进行高通量测序,并通过生物信息学软件分析变异。试剂盒含阴/阳性对照品,用于质控。
临床前研究概述
主要原材料为外购,包括富集探针、酶类、磁珠等,经供应商筛选和质量控制。企业参考品设置如下:
•
阳性参考品:2份,含NTRK1/NTRK2/NTRK3不同融合类型和丰度样本。
•
阴性参考品:1份,无变异样本。
•
最低检测限参考品:1份,含检出限水平融合样本。
•
重复性参考品:3份,包括阳性和阴性参考品。
生产工艺和反应体系经优化,确定最佳条件。分析性能评估结果如下:
•
准确性:与全外显子组测序对比,阳性符合率和阴性符合率均为100%。
•
最低检测限:肿瘤细胞含量≥20%时,50ng DNA中融合变异频率低至2%。
•
精密度:批次内/间、不同操作者、仪器和实验室间精密度良好。
•
分析特异性:无交叉反应;干扰物如福尔马林、血红蛋白等无影响。
•
肿瘤细胞含量:≥10%可检出,建议≥20%。
•
核酸提取:配套试剂符合要求。
阳性判断值通过ROC曲线法确定:嵌合reads数≥4为阳性。
稳定性研究表明,产品在-20℃±5℃(磁珠2~8℃)下有效期10个月,运输和使用稳定性符合要求。
临床评价概述
临床试验在7家机构开展,共纳入2422例FFPE样本,其中NTRK融合阳性101例。与全外显子组测序对比结果:
•
阳性符合率:98.02%(95%CI:93.07%,99.46%)。
•
阴性符合率:99.74%(95%CI:99.44%,99.88%)。
•
总符合率:99.67%(95%CI:99.35%,99.83%)。
桥接试验针对恩曲替尼伴随诊断,纳入67例阳性样本和157例阴性样本,与CTA(对比方法)结果:
•
阳性符合率:92.54%(95%CI:83.69%,96.77%)。
•
阴性符合率:99.36%(95%CI:96.48%,99.89%)。
•
总符合率:97.32%(95%CI:94.28%,98.77%)。
桥接病例客观缓解率(ORR)为71.0%,与药物临床试验一致。
产品受益风险判定
受益:作为恩曲替尼伴随诊断,筛选用药人群,使患者及时治疗。
风险评估:检测结果受样本来源、操作等因素影响,说明书已提示局限性,如样本要求、污染风险等。剩余风险防控措施包括明确预期用途和注意事项。
综合评价意见
产品符合医疗器械法规要求,安全性、有效性达标,建议准予注册。
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